天津中医药大学学报  2026, Vol. 45 Issue (2): 159-166

文章信息

马舒悦, 王爱习, 马超, 申蓉, 董雨桐, 袭恒豫, 周昆
MA Shuyue, WANG Aixi, MA Chao, SHEN Rong, DONG Yutong, XI Hengyu, ZHOU Kun
非靶向代谢组学对补骨脂乙素的HepaRG细胞毒性机制初探
Preliminary exploration of HepaRG cytotoxicity mechanism of Isobavachalcone based on non targeted metabolomics
天津中医药大学学报, 2026, 45(2): 159-166
Journal of Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, 2026, 45(2): 159-166
http://dx.doi.org/10.11656/j.issn.1673-9043.2026.02.06

文章历史

收稿日期: 2025-11-20
非靶向代谢组学对补骨脂乙素的HepaRG细胞毒性机制初探
马舒悦1 , 王爱习1 , 马超1 , 申蓉1 , 董雨桐1 , 袭恒豫1 , 周昆1,2     
1. 天津中医药大学药物安全评价中心, 天津 301617;
2. 天津中医药大学组分中药国家重点实验室, 天津 301617
摘要: [目的] 基于代谢组学技术探究补骨脂乙素(IBC)致人源肝细胞系HepaRG细胞(human hepatoma-derivedprogenitor cells)肝毒性的机制。[方法] 通过MTT法检测IBC对HepaRG细胞活力的影响,计算半数抑制率IC50值。利用Triple TOFTM5600系统检测HepaRG细胞上清在IBC干预24 h后的代谢物,采用主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析和聚类分析等多元统计方法筛选各给药组与对照组的差异代谢物,并对其进行代谢通路富集分析。[结果] 随着IBC剂量的升高,HepaRG的细胞活力显著降低。30 μmol/L时表现出较明显的细胞毒性(P < 0.05);与对照组相比,当给药浓度达到24.53 μmol/L时,细胞活力降低10%;在41.22 μmol/L时,细胞活力降低90%。通过计算,得出其IC50为32.89 μmol/L,表明IBC具有较强的肝细胞毒性作用。富集分析显示,IBC诱导HepaRG细胞损伤主要富集苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成及组氨酸代谢等途径(P < 0.05)。[结论] 补骨脂乙素能够显著抑制HepaRG细胞活性,并且通过影响苯丙氨酸、组氨酸、精氨酸、赖氨酸等细胞代谢物及苯丙氨酸、精氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成代谢通路诱导肝细胞损伤。
关键词: 补骨脂乙素    非靶向代谢组学    肝毒性    化学计量学    富集分析    
Preliminary exploration of HepaRG cytotoxicity mechanism of Isobavachalcone based on non targeted metabolomics
MA Shuyue1 , WANG Aixi1 , MA Chao1 , SHEN Rong1 , DONG Yutong1 , XI Hengyu1 , ZHOU Kun1,2     
1. Center of Drug Safety Evaluation, Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 301617, China;
2. State Key Laboratory of Component-based Chinese Medicine, Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 301617, China
Abstract: [Objective] To investigate the mechanism of hepatotoxicity of human hepatoma-derived progenitor cells (HepaRG)induced by isobavachalcone(IBC)based on metabolomics technology. [Methods] The effect of IBC on HepaRG cell viability was detected by MTT assay, and the half maximal inhibitory concentration(IC50)value was calculated. The metabolites of HepaRG cell supernatants after 24 h of IBC intervention were detected using the Triple TOFTM 5600 system, and multivariate statistical methods, such as principal component analysis, orthogonal partial least squares discriminant analysis, and cluster analysis, were used to screen for differential metabolites between each dosing group and the control group. Metabolic pathway enrichment analysis was then performed on these differential metabolites. [Results] With the increase of IBC dosage, the cell viability of HepaRG significantly decreased. At 30 μmol/L, significant cytotoxicity was observed(P < 0.001);compared with the control group, when the drug concentration reached 24.53 μmol/L, the cell viability decreased by 10%;at 41.22 μmol/L, cell viability decreased by 90%. By calculation, its IC50 was determined to be 32.89 μmol/L, indicating that IBC has strong hepatotoxic effects. Enrichment analysis showed that IBC-induced HepaRG cell damage was mainly enriched in pathways such as phenylalanine, tyrosine, and tryptophan biosynthesis, valine, leucine, and isoleucine biosynthesis, and histidine metabolism(P < 0.001). [Conclusion] Isobavachalcone can significantly inhibit the activity of HepaRG cells and induce liver cell injury by affecting cellular metabolites such as phenylalanine, histidine, arginine, and lysine, as well as the biosynthetic metabolic pathways of phenylalanine, arginine, valine, leucine, and isoleucine.
Key words: isobavachalcone    untargeted metabolomics    hepatotoxicity    stoichiometry    enrichment analysis    

随着中药的广泛使用,常有中药不良反应事件发生,尤其是中药肝损伤事件引起了世界范围内人们的广泛关注[1],因此重视中药的肝毒性,研究其肝损伤成分及作用机制仍是亟待解决的问题。补骨脂乙素(Isobavachalcone,IBC)是从补骨脂中提取的香豆素类化合物,具有抗肿瘤、抗菌、抗病毒等多种药理作用[2]。在补骨脂中的含量为0.86~6.86 mg/g,仅次于补骨脂素和补骨脂酚,且与药典中补骨脂的指标性成分补骨脂素(1.08~6.95 mg/g)和异补骨脂素(0.76~5.01 mg/g)较接近[3]。因此,本研究采取代谢组学探究补骨脂乙素对人源肝细胞系HepaRG细胞(human hepatoma-derived progenitor cells)的代谢影响,为在临床使用补骨脂预防其产生的毒性提供一定的实验依据。

1 材料与方法 1.1 细胞来源

HepaRG细胞购自上海冠导生物工程有限公司。

1.2 主要试剂

补骨脂乙素(纯度≥98%)购自成都格利普生物科技有限公司。

1.3 仪器

TripleTOFTM5600-system高分辨质谱(AB SCIEX,美国);ExionLCTM AC超高效液相色谱仪(AB SCIEX,美国);高速离心机(Thermo,美国;离心半径R=10 cm);SPARK多功能酶标仪(TECAN,瑞士)。

1.4 细胞培养及分组

在37 ℃、5% 二氧化碳的恒温恒湿培养箱中,将HepaRG细胞在含有10% 胎牛血清的1640培养基中培养。取对数生长期的HepaRG细胞以8×104 cell/mL接种在96孔板中分为对照组和给药组(5、10、15、20、25、30、35、40、45、50 µmol/L),处理24 h后,吸取细胞上清用于代谢组学检测,细胞用于MTT细胞增殖检测。

1.5 MTT法检测

待测的96孔板中每孔加入总浓度为0.5 mg/mL的MTT溶液,37 ℃孵育4 h后,弃去上清,加入二甲基亚砜,100 µL/孔,待甲瓒完全溶解后,使用酶标仪检测570 nm波长处的吸光度值。

1.6 代谢组学分析 1.6.1 细胞上清前处理

取出冻存于-80 ℃冰箱的细胞上清样本于室温解冻后,1.5 mL离心管中加入300 µL上清和1 mL乙腈,涡旋3 min,于4 ℃低温离心10 min,8 000 r/min,吸取1 mL上层清液至真空浓缩离心机下浓缩挥干,加100 µL 50% 乙腈复溶,涡旋混匀3 min,4 ℃下14 000 r/min离心10 min,吸取80 µL上层清液,4 ℃下14 000 r/min二次离心10 min,吸取60 µL上清液用于质谱检测。

1.6.2 色谱条件

Shim-pack GISSC18色谱柱(2.1×100 mm,1.9 µm),柱温为40 ℃,进样量为5 µL,流速为0.2 mL/min。流动相为0.1% 甲酸水(A)和0.1% 甲酸乙腈(B)。梯度洗脱条件为0~1 min,5% B;1~15 min,5%~95% B;15~17 min,95% B;17~ 17.1 min,95%~5% B;17.1~20 min,5% B;整个进样过程样品置于4 ℃自动进样器中。

1.6.3 质谱条件

采用电喷雾电离源(ESI源),在正、负离子电离模式下进行质谱检测分析。设置分子量扫描范围为100~1 500 m/z;喷雾电压为5 500 V;离子源温度550 ℃;气帘气35 Psi;去簇电压为80V/-80V;碰撞能量10/-10 eV[4]。本实验运用Triple TOFTM5600系统(AB SCIEX ExionLCTM AC,美国)进行代谢组学分析。

1.6.4 代谢组学数据处理与多元统计分析

采用MS-DIAL分析软件对进行峰对齐、解卷积、峰提取等处理,并对代谢物峰面积进行总峰面积归一化处理。将得到的数据导入SIMCA-P 14.1软件进行多元统计分析,包括主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)等。

1.6.5 差异代谢物及代谢通路分析

根据变量重要性投影(VIP)>1和t检验(P < 0.05)作为组间差异代谢物筛选的受限条件寻找差异代谢物,在人类代谢组数据库(HMDB)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库中检索确定差异代谢物。运用MetaboAnalyst(http://metpa.metabolomics.ca)对其进行通路富集分析,筛选相关代谢通路。

1.7 统计分析

采用Graphpad Prism 8.0进行统计学分析,实验结果均采用均数±标准差(x±s)来表示。采用单因素方差分析进行多组间差异比较,使用Tukey进行多重比较校正。P < 0.05表示具有显著性差异。

2 结果 2.1 MTT法检测细胞增殖情况

细胞培养24 h后,采用MTT法检测细胞增殖活性。随着IBC剂量的升高,HepaRG的细胞活力显著降低。30 µmol/L时表现出较为明显的细胞毒性;与对照组相比,当给药浓度达到24.53 µmol/L时,细胞活力降低10%;在41.22 µmol/L时,细胞活力降低90%(图 1,a)。通过计算,得出其IC50为32.89 µmol/L(图 1,b),表明IBC对HepaRG肝细胞有较强的细胞毒性作用。为直观展示IBC对HepaRG细胞的影响,选取4个具有代表性的浓度(对照组、无明显毒性剂量组-15 µmol/L、接近半数抑制浓度组-30 µmol/L、高毒性剂量组-45 µmol/L)在Incucyte下实时观察。结果表明,细胞形态学观察与MTT检测结果呈现一致性,对照组及低浓度组HepaRG细胞维持典型的肝细胞特征,呈多角形或短梭形,胞体紧密贴切核质比均衡,而中浓度和高浓度组则出现贴壁能力减弱、细胞变圆模糊等现象,值得注意的是,中浓度组开始出现了气泡状小泡,且随浓度升高逐渐增多。进一步验证了IBC对细胞增殖的抑制作用。

注:图a,IBC给药24 h后HepaRG细胞活力的变化;图b,HepaRG细胞经IBC诱导后的细胞形态变化。与对照组比较,***P < 0.001。 图 1 IBC对HepaRG细胞活力的影响(n=3)
2.2 代谢组学分析

基于IBC对HepaRG细胞活力的剂量依赖性抑制效应,本研究选取对照组、低浓度组(15 µmol/L)、中浓度组(30 µmol/L)、高浓度组(45 µmol/L)的细胞上清进行代谢组学分析,以揭示IBC的动态代谢过程:从低浓度亚毒性效应、中浓度代谢稳态失衡至高浓度不可逆毒性效应,同时通过对照组排除背景干扰。

2.2.1 代谢轮廓分析

对对照组、3种给药组进行PCA代谢轮廓分析,如图 2。在PCA图中对照组和给药组样本之间观察到明显的分离趋势,表明在IBC作用下HepaRG细胞的代谢产物表达呈差异性代谢特征。随IBC浓度升高,高浓度组产生显著偏移,对照组与低、中、高浓度给药组比较,通过PCA得分图说明不同组别在图中呈现出分离状态,表明IBC使HepaRG细胞的代谢产生了变化。该结果与细胞活力检测结果变化呈相似趋势。

注:图a,正离子模式;图b,负离子模式。 图 2 对照组与3种不同浓度给药组PCA得分图(n=3)
2.2.2 细胞上清OPLS-DA分析

为了进一步分析不同组之间的差异关系,更好地对模型解释,采用监督性的正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)方法,使用置换检验(n=200)对模型进行过拟合分析,分别对低、中、高3个给药组和对照组之间进行模型分析,以筛选潜在差异代谢物。OPLS-DA分析显示,低、中、高3种给药组与对照组在OPLS-DA上能完全分离,提示组间代谢差异明显(如图 34)。

注:图a,对照组与低浓度组;图b,对照组与中浓度组;图c,对照组与高浓度组。 图 3 负离子模式下3种不同浓度给药组的OPLS-DA得分图和置换检验拟合图
注:图a,对照组与低浓度组;图b,对照组与中浓度组;图c,对照组与高浓度组。 图 4 正离子模式下3种不同浓度给药组的OPLS-DA得分图和置换检验拟合图
2.2.3 差异代谢物分析

当OPLS-DA统计分析得到的VIP值>1以及t检验P < 0.05时,认为代谢物差异具有统计学意义。低浓度组与对照组比较,差异代谢物有21个;中浓度组与对照组比较,差异代谢物有29个;高浓度组与对照组比较,差异代谢物有31个(见图 5)。各组差异代谢物主要为氨基酸类、有机酸类、脂类、维生素类等。这些差异代谢物在不同给药组间区分明显,组内聚类理想,说明IBC诱导后能够引起HepaRG细胞代谢轮廓的变化。与对照组相比,聚类分析后3种给药组细胞代谢物水平均发生了显著的变化。组氨酸、亚油酸、邻苯二甲酸单酯、N-琥珀酰-L-精氨酸随着给药浓度升高,呈现显著下调的趋势;氨酰胺、赖氨酸、磷酸胆碱、吡哆醇、5-脲基-4-咪唑羧酸酯、黄嘌呤等呈显著上调趋势。不同的是,苯丙氨酸在低、中浓度下显著上调而在高浓度下显著下调(见图 6)。

图 5 各组差异代谢物韦恩图
图 6 各给药组与对照组差异代谢物热图
2.2.4 代谢通路分析

分别将上述筛选的各组差异代谢物结合MetaboAnalyst 5.0对代谢通路进行富集与分析。以P < 0.05为临界值,筛选认为其具有显著性水平的代谢富集通路,主要富集氨基酸类代谢、脂质代谢、维生素代谢等,其中氨基酸类合成途径较为显著(见图 7)。在低、中、高3种不同浓度给药组,均显著富到苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成途径;随着给药浓度的升高,精氨酸生物合成途径富集程度逐渐降低,而缬氨酸、亮氨酸生物合成途径富集程度逐渐升高。

注:图a,15 µmol/L IBC差异代谢富集分析;图b,30 µmol/L IBC差异代谢富集分析;图c,45 µmol/L IBC差异代谢富集分析。 图 7 各给药组与对照组差异代谢物通路富集分析结果
3 讨论

补骨脂作为传统补益类中药,拥有悠久的用药历史和明确的临床疗效,具有温肾助阳、温脾止泻等功效,主治肾阳不足、阳痿遗精、腰膝冷痛等[5-6]。但对其毒性记载较少,最早见于《雷公炮制论》中:“性本大燥,毒”。现代药理学研究对补骨脂中致肝毒性的各成分进行物质基础研究,主要集中于新补骨脂异黄酮、补骨脂素、异补骨脂素、补骨脂酚等[7-8],而目前对于补骨脂乙素的肝毒性作用研究较少。基于此,本研究采用通过非靶向代谢组学途径,系统筛选补骨脂乙素致肝损伤的潜在代谢标志物,以期为该成分的毒性机制研究提供科学依据。

代谢组学作为系统生物学的重要分支,凭借代谢组学对内源性和外源性的动态代谢变化提供了全面的信息,为解析药物性肝损伤的分子机制提供独特视角[9]。可鉴定及筛选药物引起肝损伤的生物标志物,在药物暴露早期识别代谢稳态失衡信号,反映从亚损伤到严重损伤的代谢变化,从而有效预防肝损伤风险[10]

本研究以HepaRG细胞外培养液为分析对象。与常规动物血清、组织匀浆样本相比,细胞外培养液中的代谢物直接源于细胞与药物相互作用及分泌活动,规避了动物样本中多器官协同代谢、微生物共代谢等复杂背景干扰;药物诱导的早期代谢响应在细胞外液中更易富集检测,而动物体内稳态环境可能弱化低剂量效应。

本研究在30 µmol/L浓度的IBC作用下,HepaRG细胞活性开始显著降低,细胞死亡率升高,表明IBC对HepaRG具有确切的毒性作用。肝脏是代谢氨基酸的重要器官,对氨基酸代谢具有重要作用,肝细胞损伤会引起氨基酸代谢紊乱[11-12]。进一步通过非靶向代谢组学验证,富集结果显示,苯丙氨酸生物合成途径则在低、中、高全浓度梯度下均显现显著富集效应,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成途径的富集效应集中显现在中、高浓度区间,精氨酸生物合成途径在低、中浓度处理组呈现显著富集特征。

亚太肝病学会共识指南指出,药物可能通过干扰氨基酸代谢通路诱发肝损伤。已有研究表明,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸可能与肝衰竭、非酒精性脂肪肝、肝性脑病等发病机制有关[13]。研究发现,苯丙氨酸等芳香族氨基酸对人乳腺癌细胞系具有显著的抑制作用,且早期研究对于苯丙氨酸代谢检测发现具有肝损伤的患者中,苯丙氨酸代谢速率与肝损伤严重程度有关,其下调可能反映肝细胞功能障碍[14-15]。因此苯丙氨酸作为必需氨基酸,当肝细胞受损时,影响苯丙氨酸代谢失衡,导致整体水平的下降。虽然低浓度组在MTT检测结果中发现并未引起细胞活力的影响,考虑其可作为早期细胞毒性筛选的潜在指标,是IBC对HepaRG细胞损伤的关键代谢途径之一。

缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸为支链氨基酸(BCAA),能够参与蛋白质代谢和各种生理代谢功能,为机体提供能量,且有研究发现通过诱导BCAA水平升高可加重肝损伤[16-17]。在中、高浓度下,亮氨酸、异亮氨酸上调,因此考虑缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成可能是IBC诱导HepaRG细胞发生严重肝损伤的关键代谢通路之一。

精氨酸属于非必需氨基酸,在肝脏保护中发挥着重要作用,可以缓解肝脏炎症和损伤等情况[18-19]。一定程度上通过精氨酸合成途径缓解IBC诱导的肝细胞损伤,适度的精氨酸上调可能是细胞对抗毒性损伤的自我保护机制,当损伤程度超过细胞代偿能力时,单纯依赖精氨酸生物合成可能不足以维持肝细胞功能。除此之外,在差异代谢物分析中发现,组氨酸在各浓度显著下调。组氨酸作为一种无法自行合成的必需氨基酸,在生物体内具有多重生理功能。研究发现组氨酸代谢下调是肝缺血再灌注损伤中的共有特征,组氨酸代谢通路下调与肝炎症和氧化应激相关,且补充组氨酸后损伤得到改善[20-21]

综上所述,IBC诱导HepaRG细胞毒性的潜在机制可能涉及氨基酸代谢紊乱,主要通过以下代谢通路调控:通过抑制苯丙氨酸生物合成通路,同时激活缬氨酸、亮氨酸及异亮氨酸合成途径。值得注意的是,虽然精氨酸生物合成相关通路呈现上调趋势,但在高浓度暴露条件下其代谢产物并未出现显著累积现象。代谢途径与肝损伤的关联涉及多机制交叉,后续还需通过酶活性检测、功能实验等进一步验证以上代谢通路的具体调控作用,为全面深入探究补骨脂乙素致肝损伤的作用机制提供了理论依据。

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