天津中医药大学学报  2026, Vol. 45 Issue (6): 673-679

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裴天仙, 袭恒豫, 张洲, 王逸涵, 马超, 王学童, 周昆
PEI Tianxian, XI Hengyu, ZHANG Zhou, WANG Yihan, MA Chao, WANG Xuetong, ZHOU Kun
HepaRG细胞3D培养和代谢组学的新补骨脂异黄酮肝毒性研究
Study on the hepatotoxicity of neobavaisoflavone based on 3D culture of heparg cells and metabolomics
天津中医药大学学报, 2026, 45(6): 673-679
Journal of Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, 2026, 45(6): 673-679
http://dx.doi.org/10.11656/j.issn.1673-9043.2026.06.07

文章历史

收稿日期: 2025-12-20
HepaRG细胞3D培养和代谢组学的新补骨脂异黄酮肝毒性研究
裴天仙1 , 袭恒豫1 , 张洲2 , 王逸涵1 , 马超1 , 王学童1 , 周昆1,3,4     
1. 天津中医药大学药物安全评价中心,天津 301617;
2. 天津天诚新药评价有限公司,天津 300301;
3. 现代中药创制全国重点实验室,天津 301617;
4. 组分中药国家重点实验室,天津 301617
摘要: [目的] 基于HepaRG细胞3D培养和代谢组学技术,研究新补骨脂异黄酮(NBIF)的肝毒性,并探讨其可能的机制。[方法] HepaRG细胞3D培养至第4天时,NBIF 0、2.5、5.0、10.0 μmol/L给药,每天1次,连续5次。第1次和第5次给药24 h后,细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法测定HepaRG细胞活力;第5次给药24 h后,流式细胞仪测定HepaRG细胞凋亡率,基于超高效液相色谱-串联飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术并结合多元统计分析方法,对细胞上清代谢谱进行分析,筛选差异代谢物及相关代谢通路。[结果] 随着NBIF给药浓度的升高和给药次数的增加,HepaRG细胞肝细胞活力降低;与对照组(6.86%)比较,NBIF 5.0 μmol/L(11.56%)、10.0 μmol/L(28.44%)组HepaRG细胞的早期凋亡率升高;与对照组比较,NBIF给药筛出17个差异代谢物,含量均下调,NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组分别涉及5、6和6条通路。[结论] 新补骨脂异黄酮可致3D培养HepaRG细胞活力降低、凋亡率升高,其毒性机制可能与苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、苯丙氨酸的代谢、脂肪酸及不饱和脂肪酸的生物合成等脂质代谢途径紊乱有关。
关键词: 新补骨脂异黄酮    肝毒性    HepaRG细胞    3D培养    代谢组学    脂质代谢    
Study on the hepatotoxicity of neobavaisoflavone based on 3D culture of heparg cells and metabolomics
PEI Tianxian1 , XI Hengyu1 , ZHANG Zhou2 , WANG Yihan1 , MA Chao1 , WANG Xuetong1 , ZHOU Kun1,3,4     
1. Center of Drug Safety Evaluation, Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 301617, China;
2. Tianjin Tiancheng New Drug Evaluation Co., Ltd., Tianjin 300301, China;
3. National Key Laboratory of Chinese Medicine Modernization, Tianjin 301617, China;
4. State Key Laboratory of Component⁃based Chinese Medicine, Tianjin 301617, China
Abstract: [Objective] To investigate the hepatotoxicity of neobavaisoflavone(NBIF) and explore its potential mechanism based on 3D culture of HepaRG cells and metabolomics technology. [Methods] HepaRG cells were subjected to 3D culture for 4 days, followed by treatment with NBIF at concentrations of 0, 2.5, 5, and 10 μmol/L once daily for 5 consecutive days. At 24 h after the first and fifth administrations, the viability of HepaRG cells was determined by the CCK-8 assay. At 24 h after the fifth administration, the apoptosis rate of HepaRG cells was detected by flow cytometry. Ultra-performance liquid chromatography-tandem time-of-flight mass spectrometry (UPLC-Q-TOF-MS)combined with multivariate statistical analysis was employed to analyze the metabolic profiles of cell supernatants, so as to screen differential metabolites and related metabolic pathways. [Results] With the increase of NBIF concentration and administration frequency, the viability of 3D-cultured HepaRG cells decreased significantly. Compared with the control group(6.86%), the early apoptosis rates of HepaRG cells in the 5 μmol/L (11.56%)and 10 μmol/L(28.44%)NBIF groups were notably elevated. A total of 17 differential metabolites with downregulated levels were identified in the NBIF-treated groups compared with the control group. Moreover, 5, 6, and 6 metabolic pathways were involved in the 2.5, 5 and 10 μmol/L NBIF groups, respectively. [Conclusion] NBIF can reduce the viability and increase the apoptosis rate of 3D-cultured HepaRG cells. Its hepatotoxic mechanism may be associated with the disorder of multiple metabolic pathways, including the biosynthesis of phenylalanine, tyrosine and tryptophan, phenylalanine metabolism, as well as the biosynthesis of fatty acids and unsaturated fatty acids.
Key words: neobavaisoflavone    hepatotoxicity    HepaRG cells    3D-culture    metabolomics    lipid metabolism    

近年来,随着对补骨脂的研究不断深入以及应用范围的扩大,有关补骨脂导致肝损伤的报道日益增多,严重影响了其临床应用的安全性 [1-2]。新补骨脂异黄酮(NBIF)是从补骨脂中提取分离获得的黄酮类化合物,具有抗菌 [3]、抗炎 [4]、抗癌 [5]、抗骨质疏松 [6]等药理活性。NBIF是补骨脂肝毒性的主要成分之一 [7],其在人体和动物体内的毒性鲜有报道,但是已有研究证实NBIF在HepG2细胞、LO2细胞上显示出强烈的细胞活力抑制作用,具有较强的肝细胞毒性作用 [8],但对其机制的研究尚不深入。

HepaRG细胞作为目前公认的“最接近人原代肝细胞”的永生化肝细胞系,在体外肝研究领域应用广泛。而3D培养技术通过重构细胞间三维空间结构与微环境,进一步放大了HepaRG细胞的生理模拟能力,使其在药物肝毒性研究中展现出远超传统2D培养的优势 [9-10],核心在于更精准复现人肝细胞的结构特征、功能状态及毒性响应规律,为体外肝毒性评价提供更可靠的“人体替代模型”。本研究旨在利用3D培养的HepaRG细胞球模型结合代谢组学技术,探究新补骨脂异黄酮导致肝毒性的相关代谢途径,为深入理解其肝毒性机制提供关键的实验数据,为进一步研究提供参考。

1 材料 1.1 受试药

NBIF,购于成都格利普生物科技有限公司。

1.2 细胞株

HepaRG细胞,购自上海冠导生物工程有限公司。

1.3 试剂

RPMI 1640培养基,美国Gibco公司;胎牛血清,北京全式金生物技术有限公司;细胞计数试剂盒-8(CCK-8),美国GLPbio公司;Annexin VFITC/PI荧光双染细胞凋亡检测试剂盒,武汉伊莱瑞特生物科技股份有限公司;乙腈(色谱级),购自美国Sigma公司。

1.4 仪器

Spark酶标仪(瑞士TECAN),Guava easyCyte流式细胞仪(美国Luminex公司),超高效液相色谱仪ExionLC(美国AB SCIEX公司),高分辨质谱仪Triple TOF 5600 system(美国AB SCIEX公司)。

2 方法 2.1 HepaRG细胞3D培养及给药

HepaRG细胞采用含有10%胎牛血清的1640完全培养基,置37 ℃、5%二氧化碳(CO2)培养箱中培养。当细胞生长达80%融合时,用0.25%胰蛋白酶消化,以4.5×104细胞/mL的接种密度接种于低吸附U形底96孔板,200 μL/孔,构建HepaRG细胞3D培养模型。培养至第4天,分为4组,依据课题组前期的研究基础 [11]设置给药浓度,即0、2.5、5.0、10.0 μmol/L组,分别为NBIF 0、2.5、5.0、10.0 μmol/L给药,每天1次,连续5次。

2.2 CCK-8法测定细胞活力

单次和第5次给药24 h后,每孔加入10%的CCK-8,于恒温培养箱中孵育4 h后,用酶标仪测定在450 nm处的吸光度,计算细胞活力。细胞活力(%)=(OD测量值-外径空白值)(/OD对照值-外径空白值)×100%。

2.3 流式细胞仪测定细胞凋亡

采用AnnexinV/PI双染色法。5次给药24 h后,磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤3次,消化、收集细胞,随后加入100 μL结合缓冲液重悬细胞。加入10 μL Annexin V-FITC和5 μL PI室温避光孵育15 min。随后加入400 μL结合缓冲液混合均匀,过滤后,流式细胞仪检测。

2.4 代谢组学分析 2.4.1 细胞上清液制备

使用无菌移液器轻柔吸取培养孔内“HepaRG细胞-培养基”混合液,转移至预冷的1.5 mL低吸附离心管中,4 ℃条件下300×g离心5 min,吸取上清液,过滤,冻存,待代谢组学检测。

2.4.2 细胞上清前处理

上清样本于室温解冻后,1.5 mL离心管中加入300 μL上清和1 mL乙腈,涡旋3 min,于4 ℃低温离心10 min,8 000 r/min,离心半径8.2 cm,吸取1 mL上层清液至真空浓缩离心机下浓缩挥干,加100 μL 50%乙腈复溶,涡旋混匀3 min,4 ℃下14 000 r/min离心10 min,吸取80 μL上层清液,4 ℃下14 000 r/min二次离心10 min,吸取60 μL上清液用于质谱检测。

2.4.3 色谱条件

Shim-pack GISSC18色谱柱(2.1mm×100 mm,1.9 μm),柱温为40 ℃,进样量为5 μL,流速为0.2 mL/min。流动相为0.1%甲酸水(A)和0.1%甲酸乙腈(B)。梯度洗脱条件为0~1 min,5%B;1~15min,5%~95% B;15~17 min,95% B;1717.1 min,95%~5% B;17.1~20 min,5% B;整个进样过程样品置于4 ℃自动进样器中。

2.4.4 质谱条件

采用电喷雾电离源(ESI源),在正、负离子电离模式下进行质谱检测分析。设置分子量扫描范围为100~1 500 m/z;喷雾电压为5 500 V;离子源温度550 ℃;气帘气35 Psi;去簇电压为80 V/-80 V;碰撞能量10/-10 eV。本实验运用Triple TOFTM5600系统(AB SCIEX ExionLCTM AC,美国)进行代谢组学分析。

2.4.5 代谢组学数据处理与多元统计分析

原始质谱数据由Analyst Software 1.6.1收集处理。数据归一化后,导出到SIMCA-P V14.1进行多元统计分析,Metabo Analyst进行通路分析。

2.4.6 差异代谢物及代谢通路分析

根据变量重要性投影(VIP) > 1和t检验(< 0.05)作为组间差异代谢物筛选的受限条件寻找差异代谢物。运用MetaboAnalyst(http://metpa.metabolomics.ca)网站对筛选出的差异代谢物进行通路富集分析,筛选相关代谢通路。

2.5 统计学分析

采用SPSS 20.0统计学软件,数据以均数±标准差(x±s)表示,采用方差分析比较各组间差异。

3 结果 3.1 HepaRG细胞3D培养模型的建立

HepaRG细胞在重力的作用下,逐渐聚集,建立细胞与细胞之间的联系,形成稳定类器官球体,3D培养模型建立成功,可进行后续的药物毒性实验。见图 1

图 1 HepaRG细胞3D培养模型
3.2 NBIF对3D培养HepaRG细胞活力的影响

图 2所示,单次给药后,与NBIF 0 μmol/L组比较,NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组HepaRG细胞活力未见明显变化(见图 2A)。5次给药后,与对照组比较,NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组HepaRG细胞活力可见剂量依赖性降低,其中NBIF10组降低显著(P < 0.01)(见图 2B)。比较单次给药和重复5次给药后细胞活力结果(见图 2C),可见随着给药浓度的升高和给药次数的增加,NBIF对3D培养HepaRG细胞活力的影响具有剂量依赖性降低作用和积累效应。

注:图A,NBIF单次给药后HepaRG细胞活力变化;图B,NBIF5次给药后HepaRG细胞活力变化;图C,NBIF单次和5次给药后HepaRG细胞活力变化对比。与对照组比较,**P<0.01。 图 2 NBIF单次和5次给药对HepaRG细胞活力的影响(x±sn=3)
3.3 NBIF对3D培养HepaRG细胞凋亡的影响

5次给药后,HepaRG细胞早期凋亡率在NBIF 0 μmol/L组为6.86%,NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组分别为3.84%、11.56%、28.44%,与对照组比较,NBIF 5.0、10.0 μmol/L组HepaRG细胞的早期凋亡率明显升高。见图 3

注:图A,(AnnexinV-FITC)-/PI+代表坏死细胞;图B,(AnnexinV-FITC)+/PI+代表晚期调亡细胞;图C,(AnnexinV-FITC)-/PL代表正常活细胞;图D,(AnncxinV-FITC)+/PL代表早期调亡的细胞。 图 3 NBIF给药对HepaRG细胞凋亡的影响
3.4 NBIF对3D培养HepaRG细胞代谢组学的影响 3.4.1 细胞上清样本代谢产物鉴定分析

对细胞上清样品的质谱原始数据进行预处理后,上传MetDNA线上代谢组学数据分析平台得到代谢物鉴定的结果。结果显示,在5次给药后,正离子模式下,检测出50个有代谢物的峰,共鉴定出16个代谢产物;在负离子模式下,检测出275个有代谢物的峰,共鉴定出53个代谢产物。

3.4.2 多元统计分析

PCA结果表明,在正、负离子模式下,NBIF 0、2.5、5.0、10.0 μmol/L 4组代谢物基本分别聚集,得到较好的分离,说明NBIF使3D培养HepaRG细胞代谢产生了变化,见图 4。采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)寻找组间差别,如图 5所示,在正、负离子模式下,NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组与NBIF 0 μmol/L组之间均呈现出组内聚集与组间分散的趋势,提示2.5、5.0、10.0 μmol/L给药浓度下的NBIF对细胞代谢物均产生了明显的影响。通过200次置换检验对模型进行验证,如图 6所示,正负离子模式下,R2和Q2分别低于最右的原值,且Q2与Y轴相交于负半轴,表明该模型没有过拟合且预测能力良好。观察VIP-plot图可知,顶端的离子VIP值相对较高,对代谢轮廓的变化贡献较大,底部的离子VIP值相对较低,对代谢轮廓的变化贡献较小。

注:图A,正离子模式下NBIF 0、2.5、5.0、10.0 μmol/L组间比较PCA得分图;图B,负离子模式下NBIF 0、2.5、5.0、10.0 μmol/L组间比较PCA得分图。 图 4 细胞上清样品PCA得分图
注:图A、B、C分别为正离子模式下NBIF 0 μmol/L与NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组间比较OPLS-DA得分图;图D、F、G分别为负离子模式下NBIF 0 μmol/L与NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组间比较OPLS-DA得分图。 图 5 细胞上清样品OPLS-DA得分图
注:图A、B、C为正离子模式下NBIF 0 μmol/L与NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L的置换检验结果;图D、E、F为负离子模式下NBIF 0 μmol/L与NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L置换检验结果。 图 6 细胞上清样品置换检验结果
3.4.3 差异代谢物筛选

在建立OPLS-DA模型基础上,选择VIP > 1,P < 0.05作为筛选潜在差异代谢物的条件。5次给药,共筛出17个差异代谢物,含量均下调,如表 1所示。

表 1 给药组与对照组间差异代谢标志物鉴定及变化趋势
代谢物 ESI模式 m/z Rt(s) 趋势
0-2.5 0-5 0-10
精氨酸(Arginine) + 175.1178 113.8
1-(2-羟乙基)-2, 2, 6, 6-四甲基-4-哌啶醇(1-(2-Hydroxyethyl)-2, 2, 6, 6-tetramethyl-4-piperidinol) + 202.1803 1153.1
焦谷氨酸(Pyroglutamic acid) - 128.0358 98.2 - -
正亮氨酸(Norleucine) - 130.0874 130.4
赖氨酸(Lysine) - 145.0985 1174.3 - -
组氨酸(Histidine) - 154.0633 233.5 - -
苯丙氨酸(Phenylalanine) - 164.0712 196.1
吡哆醇(Pyridoxine) - 168.0667 243.8
精氨酸(Arginine) - 173.1051 1173.7
葡萄糖(Glucose) - 179.0560 101.6 -
酪氨酸(Tyrosine) - 180.0657 142.7
苯乙酰甘氨酸(Phenylacetylglycine) - 192.0660 122.9 - -
色氨酸(Tryptophan) - 203.0819 255.8
肉豆蔻酸(Myristic acid) - 227.2015 595.4
二甲基异咯嗪(Lumichrome) - 241.0740 447.5
棕榈酸(Palmitic acid) - 255.2324 708.6
硬脂酸(Stearic acid) - 269.2493 951.1
注:↓:与对照组比较含量下降;↑:与对照组比较含量升高;-:与对照组比较含量无明显变化。
3.4.4 代谢通路分析

将上述筛选出的代谢差异物导入Metaboanalyst5.0数据库进行代谢通路分析,以-log(p) > 1,Pathway impact > 0为筛选标准,筛选出潜在的代谢通路,NBIF 0 μmol/L与NBIF 2.5、5.0、10.0 μmol/L组间比较分别得到5、6和6条通路,包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、苯丙氨酸代谢、不饱和脂肪酸的生物合成、脂肪酸生物合成、维生素B6代谢、精氨酸生物合成等通路(见图 7)。图中纵坐标-log(p)代表通路的显著性水平,值越大节点则颜色越深;横坐标为通路影响值(Pathway impact),代表代谢通路影响的重要程度。结果表明,给药组细胞上清代谢物与酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸生物合成、苯丙氨酸代谢相关性最强,其次为不饱和脂肪酸及脂肪酸的生物合成。

注:图A,NBIF2.5与NBIF0差异代谢物的主要代谢通路;图B,NBIF5、10与NBIF0差异代谢物的主要代谢通路。a,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成;b,苯丙氨酸代谢;c,脂肪酸的生物合成;d,维生素B6代谢;e,精氨酸生物合成;f,淀粉和蔗糖代谢。 图 7 各给药组与对照组间差异代谢物的主要代谢通路
4 讨论

NBIF是从补骨脂中分离而得,与直接靶标mTOR结合良好,是其肝毒性分子起始事件之一 [12]。本研究中,新补骨脂异黄酮可致3D培养HepaRG细胞活力降低,这确认新补骨脂异黄酮对3D培养HepaRG细胞有毒性。

代谢组学通过分析生物体的代谢产物反映机体整体的代谢情况,与中医的整体观一致,在确定毒性生物标志物和潜在的毒性作用机制方面具有显著的优势,已被初步应用于肝毒性、肾毒性、心脏毒性等多种毒性的评估 [13-14]

代谢组研究结果显示,与对照组比较,新补骨脂异黄酮处理组的代谢物中共筛出17个差异代谢物,含量均下调,代谢物与酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸生物合成、苯丙氨酸代谢相关性最强,其次为不饱和脂肪酸及脂肪酸的生物合成。而苯丙氨酸和色氨酸人体细胞无法合成,细胞上清代谢物中苯丙氨酸和色氨酸含量降低,可能是HepaRG细胞对细胞上清中苯丙氨酸和色氨酸的摄取、利用增加所致。

苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸是芳香族必需氨基酸,对于肝细胞有着相当重要的影响。苯丙氨酸参与了组织蛋白质的构成,其主要的代谢途经被认为是在肝脏等组织中,通过苯丙氨酸羟化酶的作用转化生成酪氨酸,进而参与合成某些激素和神经递质等。苯丙氨酸和酪氨酸均参与了合成激素、神经递质、糖代谢与脂代谢。而色氨酸则在蛋白质生物合成中起到重要作用,已经被证明参与了氧化应激和炎症反应。由于大部分色氨酸在肝脏中代谢,药物导致肝损伤时通常会伴有色氨酸的代谢紊乱。

此外,NBIF给药后细胞上清的差异代谢物中,不饱和脂肪酸肉豆蔻酸和棕榈酸、饱和脂肪酸硬脂酸均显著下调,说明NBIF导致了脂肪酸的生物合成等脂质代谢紊乱。

综上所述,NBIF对HepaRG细胞的3D细胞球有显著的细胞毒性,给药后引起了苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸合成代谢紊乱以及脂质代谢紊乱,可能进一步引发氧化应激等相关的肝细胞凋亡(如结果所示),但引起肝细胞凋亡的确切机制,还有待进一步研究。

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